MFE 2012-2013From LISAModélisation 3D à partir d'images. (Alessandro Fontana)Description : L'utilisation de scanners 3D étant coûteuse, la photogrammétrie est de plus en plus utilisée pour modéliser en 3D des objets, des bâtiments ou des sites. Des logiciels ont été développés dans des universités pour générer un nuage de points 3D colorés à partir d'images, puis pour reconstruire une surface 3D (exemple : //grail.cs.washington.edu/software/pmvs/). D'autre part, l'apparition de drônes 3D bon marché équipés de caméras permet d'obtenir facilement un grand nombre d'images d'un site. Le but du mémoire est d'efectuer un état de l'art des logiciels existants et de mettre en oeuvre une solution complète (logicielle + matérielle) effectuant l'acquisition des données et leur traitement pour obtenir un modèle 3D texturé et sans trous d'un objet ou d'un site.
Contacts :Nadine Warzée (nawarzee_AT_ulb.ac.be), Rudy Ercek (rercek_AT_ulb.ac.be), Arnaud Schenkel (aschenke_AT_ulb.ac.be)
Amélioration de la structure des complexes d’aiguillages. (libre)Description : A l’entrée des gares, les trains sont dirigés vers les quais en passant par des complexes d’aiguillages. Ceux-ci agissent comme des échangeurs routiers ou des centraux téléphoniques et sont établis sur base d’exigences d’exploitation à chaque fois spécifiques. Ces ensembles peuvent compter chacun plus de 100 aiguillages. Infrabel, gestionnaire de l’infrastructure ferroviaire belge, cherche à réduire progressivement ce nombre, à en simplifier la structure et ainsi à en réduire les coûts d’établissement et de maintenance. Pour rencontrer cet objectif, des outils informatiques seront développés pour étudier de manière approfondie l’exploitation et la circulation des trains dans ces ensembles, pour mieux évaluer leur disponibilité et pour produire des schémas alternatifs améliorant leur performance globale. Ce travail d’analyse et de développement informatique sera réalisé en collaboration avec la Direction Infrastructure d’Infrabel, service Signalisation. Contacts :Louis Brabant (louis.brabant_AT_INFRABEL.BE), Dominique Buset (dbuset_AT_ulb.ac.be), Nadine Warzée (nawarzee_AT_ulb.ac.be)
Conception / adaptation d’un logiciel de gestion de l’information sanitaire à destination des services de santé des pays en développement. (Hortense Maskens)Description : Début des années 90, afin de soutenir le fonctionnement du système d’informations sanitaires de trois zones de santé en République démocratique du Congo, un logiciel, appelé GESIS, a été développé par l’ONG CEMUBAC de l’ULB (voir http://www.cemubac.org/) en collaboration avec AEDES (voir http://www.aedes.be/view/fr/Presentation.html). Ce logiciel a été conçu pour permettre à des personnes ayant des compétences très limitées en informatique de saisir et d’analyser les données d’activités produites par les structures de santé. Après de multiples évolutions et adaptations, ce logiciel a été utilisé et est encore utilisé, à des niveaux divers, dans différents pays d’Afrique. Il est aujourd’hui notamment utilisé au niveau national à Madagascar et au Burundi. Il est installé progressivement sur l’ensemble des provinces de la République du Congo (voir fiche descriptive en annexe). Le logiciel GESIS a, afin de faciliter un transfert technologique vers des informaticiens locaux, été développé en ACCESS. Régulièrement, les adaptations nécessaires ont été faites pour lui permettre de suivre l’évolution de Microsoft mais GESIS commence à souffrir des choix techniques faits il y a plus de 20 ans. Une révision de l’analyse et une réécriture complète du logiciel s’impose. Objectifs Elaborer une nouvelle version du logiciel GESIS en répondant aux contraintes d’utilisation liées au contexte des pays en développement, en permettant un transfert aisé de la maintenance et du développement du logiciel vers des informaticiens nationaux et en intégrant, dans la mesure du possible, les évolutions technologiques. Description du travail demandé Le logiciel GESIS existant ainsi que ses manuels d’utilisation et de programmation seront mis à disposition. Des séances de travail avec le responsable du développement de GESIS pourront être organisées afin de définir les forces et les faiblesses du logiciel. Des séances de travail avec des acteurs de terrain permettront de se familiariser avec les contraintes d’utilisation du logiciel rencontrées sur le terrain telles que les compétences des utilisateurs, le matériel disponible, l’environnement, etc. Sur base de l’analyse effectuée, un cahier des charges sera élaboré. Dans la mesure du possible, afin de gagner du temps, il pourra être élaboré en faisant référence au GESIS existant (ce qu’on garde, ce qu’on change) sans devoir tout réécrire. Le cahier des charges précisera un ordre de priorité pour les développements futurs. Sur base du cahier des charges et des contraintes, différentes pistes techniques pourront être envisagées. Leurs avantages et inconvénients devront être analysés. La piste « ACCESS » ne devra pas obligatoirement être écartée et doit pouvoir être analysée avec objectivité. Développement de l’application sur base du cahier des charges. Si l’application développée est opérationnelle, un séjour sur le terrain est prévu pour mettre en place le système, former les partenaires et permettre une première évaluation. Collaborations Ce travail sera réalisé en partenariat avec la CODEPO et le CEMUBAC. Contacts :Antoine Nonclercq (anoncler_AT_ulb.ac.be), Nadine Warzée (nawarzee_AT_ulb.ac.be), Alain Wodon (CEMUBAC) (alain.wodon_AT_cemubac.org)
Organisation du dossier familial au sein d’un centre de santé de référence en RDC. (Fabian Janssens)Description : Contexte Pour faire face à la piètre qualité de l’offre de soins dans la ville de Kinshasa, la MECRECO, mutuelle d’épargne et de crédit active sur l’ensemble de la RDC, désire mettre en place un centre de santé de bon niveau capable de répondre efficacement aux principaux besoins de santé de ses membres. Ce centre répondra aux principes d’organisation des soins de santé primaires et offrira aux membres et à leurs familles une prise en charge globale couvrant les soins préventifs et les soins curatifs de premier niveau. Pour les soins curatifs plus complexes, les patients seront référés vers une structure hospitalière plus développée. Un des éléments clés d’une bonne prise en charge globale des patients est la mise en place d’un dossier familial permettant de suivre l’évolution de l’état de santé de tous les membres d’une même famille. L’expérience montre que cette mise en place est assez complexe et doit faire face à de multiples problèmes. La reconnaissance des membres de la famille qui ont droit à des soins gratuits est déjà un problème non trivial. Des dossiers exclusivement papier ne sont pas gérables. Une informatisation complète n’est pas imaginable. Des solutions alternatives doivent être trouvées. Objectifs Proposer l’architecture du système d’information du centre de santé, adaptée aux conditions locales, permettant la tenue et l’utilisation des dossiers familiaux et répondant aux besoins quotidiens du personnel. Description du travail demandé Un voyage sur place devra permettre d’analyser l’organisation de la structure, de préciser le contenu de la demande et d’identifier les contraintes à prendre en compte. Sur base de l’analyse, un cahier des charges complet de la demande sera élaboré. Un plan du circuit de l’information devra être proposé. Il décrira toutes les étapes de collecte et de traitement de l’information depuis le moment de l’inscription d’un patient jusqu’au stockage final de l’information. Le design des différents supports devra être décrit précisément qu’il s’agisse des supports « papier » (fiche, registre, bon…) ou des supports informatiques. En fonction des besoins et des contraintes identifiées, les meilleurs choix techniques devront être proposés. Les questions suivantes sont parmi celles qui devront trouver réponse : • Comment identifier les patients et les associer au dossier familial ? • Comment intégrer l’outil informatique dans le système sans en paralyser tout le fonctionnement en cas de panne ? • Comment assurer la maintenance et l’évolutivité du système ? Les premiers éléments du système informatique proposé seront développés.
Collaborations : Ce travail sera réalisé en partenariat avec la CODEPO et le CEMUBAC. Contacts :Antoine Nonclercq (anoncler_AT_ulb.ac.be), Nadine Warzée (nawarzee_AT_ulb.ac.be), Alain Wodon (CEMUBAC) (alain.wodon_AT_cemubac.org)
Comparaison de critères de sélection de variables quantitatives dans les algorithmes d'arbre de décision/classification. (libre)Description : Pré-requis: analyse de données multivariées, notions de classification supervisée, notions de programmation Contacts :Christine Decaestecker (cdecaes_AT_ulb.ac.be)
Développement d'un système d'analyse d'images échographiques des structures intramusculaires. (Yves-Remi Van Eycke <yveycke_AT_ulb.ac.be>)Description : • un traitement de l'image afin d'augmenter la luminance des pixels situés au niveau des structures musculaires à analyser; • de positionner des marqueurs sur des points particuliers de ces structures (zones cibles); • de développer un algorithme permettant aux marqueurs de suivre les zones cibles et de calculer l'amplitude de leur déplacements; Ce programme devra notamment offrir la possibilité de suivre plusieurs marqueurs au cours d'une même séquence d'analyse, de permettre de choisir les durées ainsi que les moments de début et de fin des séquences d'analyse sur base de signaux relatifs au déplacement du centre de masse de la personne. Le mémoire sera réalisé en collaboration avec le laboratoire de biologie appliquée - Faculté des sciences de la motricité (campus Erasme) Contacts :Jacques Duchateau (jduchat_AT_ulb.ac.be), Nadine Warzée (nawarzee_AT_ulb.ac.be), Olivier Debeir (odebeir_AT_ulb.ac.be)
Extraction automatique de mesures par compartiment cellulaire à partir d'images de cellules acquises par microscope à fluorescence. (Alaa Hage <Alaa.Hage_AT_ulb.ac.be>)Description : Contacts :Olivier Debeir(odebeir_AT_ulb.ac.be), Christine Decaestecker (cdecaes_AT_ulb.ac.be)
Modélisation spatio-temporelle de la forme des cellules observée in vitro par contraste de phase. (libre)Description : Contacts :Olivier Debeir(odebeir_AT_ulb.ac.be), Christine Decaestecker (cdecaes_AT_ulb.ac.be)
Segmentation hiérarchique d'images obtenues par scanner haute résolution de lames histopathologiques. (libre)Description : Contacts :Olivier Debeir(odebeir_AT_ulb.ac.be), Xavier Moles Lopez (xmoleslo_AT_ulb.ac.be), Christine Decaestecker (cdecaes_AT_ulb.ac.be)
Développement d’un système de vision et d’un programme de segmentation de tissu (libre)Description : Le travail consistera à développer un système de vision pour : 1. Déterminer précisément la forme du morceau de tissu avant son positionnement sur le réseau d’électrode (segmentation de l’image basée sur la texture) ; 2. Localiser initialement ce morceau de tissu par rapport à des repères fixes placés sur le robot de placement pour connaître avec précision sa position et son orientation ; 3. Rechercher des points de repère qui auront été placé préalablement sur ce morceau de tissu et qui serviront à l’étape suivante de l’étude (ces repères seront des injections d’encre de chine) En effet, les propriétés électriques du tissu que l’on cherche à mesurer sont fonction de la forme du réseau de cellules (cellules interstitielles de Cajal). Une étape de la recherche devrait mener à reproduire cette géométrie particulière par microscopie. Afin de mettre en relation les mesures électriques précédemment effectuées sur le réseau d’électrodes et ce que l’on peut observer par microscopie, il faut être capable de mettre en correspondance les endroits stimulés et les endroits visualisés. Contacts :Antoine Nonclercq (anoncler_AT_ulb.ac.be), Olivier Debeir(odebeir_AT_ulb.ac.be),Nicolas Julémont (njulemon_AT_ulb.ac.be)
Application de la méthode des particle filter à la segmentation d'images échographiques. (libre)Description : Le travail consistera à développer: 1. mettre en oeuvre un système de filtre à particule et le tester sur des images synthétiques entièrement connues 2. définir un modèle relatif à la zone observée par l'échographie 3. chercher à optimiser le temps de calcul et critiquer la qualité des résultats obtenus Le mémoire sera réalisé à partir de données fournies par le laboratoire de biologie appliquée - Faculté des sciences de la motricité (campus Erasme) Contacts :Olivier Debeir (odebeir_AT_ulb.ac.be)
Développement d'un fantôme pour la standardisation de l'imagerie de perfusion (IRM). (libre)Description : Le projet consiste à développer une méthode de validation pour l' imagerie de perfusion en résonance magnétique. Dans la littérature on trouve plusieurs publications contradictoires ceci étant dû aux des différentes méthodes de modélisation et de post traitement. Le projet s'inscrira dans le développement d'un fantôme et d'un logiciel pour standardiser la procédure. Le mémoire sera réalisé en collaboration avec l'institut Bordet Contacts :Olivier Debeir (odebeir_AT_ulb.ac.be), Stylianos Drisis (Stylianos.Drisis_AT_ulb.ac.be)
Moteur de rendu de nuages de points. (Gautier Devuyst <gdevuyst_AT_ulb.ac.be>)Description : Les technologies de numérisation produisent des modèles tridimensionnels de tailles de plus en plus grandes, favorisant l'utilisation de nuages de points pour un rendu à l'écran. Par contre, de tels rendus ne donnent pas toujours visuellement de très beaux résultats (vision d'un modèle troué, visibilité de points qui devraient être cachés...). Le projet porte donc sur l'implémentation d'un moteur de rendu de nuages de points sur GPU, permettant d'avoir l'impression d'un modèle complet et lui supprimant les parties normalement cachées. Contacts :Olivier Debeir (odebeir_AT_ulb.ac.be), Arnaud Schenkel (aschenke_AT_ulb.ac.be)
Etude de la perfusion et de la fonction hépatique en Imagerie par Résonance magnétique. (libre)Description : Contacts :Thierry Metens <tmetens_AT_ulb.ac.be>, Vincent Denolin <vincent.denolin_AT_philips.com>, Dr M A Bali (Radiologue, Erasme), Olivier Debeir <odebeir_AT_ulb.ac.be>
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